В целях реализации переданных полномочий, оперативного сотрудничества и координации деятельности главным управлением по земельному и фитосанитарному надзору в Севастополе («Севсельхознадзор») был заключен ряд соглашений о взаимодействии с иными органами государственной власти организациями. Предметом данных соглашений прежде всего являются активное взаимодействие сторон и информационный обмен сведениями, представляющими для них взаимный интерес.Так, по состоянию на 13.02.2015 г. заключены соглашения с управлением государственной регистрации права и кадастра Севастополя, управлением Федерального агентства по государственным резервам по Южному федеральному округу, главным управлением природных ресурсов и экологии в городе Севастополе, Севастопольской торгово-промышленной палатой, управлением Федеральной службы судебных приставов в городе Севастополе, службой по Севастополю в структуре регионального управления Федеральной службы Российской Федерации по контролю за оборотом наркотиков по Республике Крым, филиалом федерального государственного бюджетного учреждения «Всероссийский центр карантина растений» в Республике Крым.
Также в дальнейшем планируется заключение соглашений о взаимодействии с иными органами государственной власти, местного самоуправления, общественными объединениями и организациями.